Kick-Off Meeting zum Start des Projekts GENESIS LiVE
von Hochschlue Harz
Zum Start des Projekts unter dem Namen „GENESIS LiVE“ fand am 08.01.2025 das Kick-Off Meeting statt, zu welchem sich die am Projekt mitarbeitenden Personen an der Hochschule Harz trafen.
Das von Sachsen-Anhalt WISSENSCHAFT Forschung und Innovation (EFRE) geförderte Projekt soll dazu dienen, anhand von Genomdaten eine Vorhersage über die Pathogenität verschiedener Listerien-Subtypen zu treffen. Listeria monocytogenes ist ein Lebensmittelpathogen, was vor allem bei schwangeren und immunsupprimierten Personen lebensbedrohliche Krankheiten auslösen kann. Im Laufe des Projekts sollen Machine-Learning und Deep-Learning Mechanismen dazu verwendet werden, anhand der Genomdaten Aussagen über die Pathogenität neuer Listerien-Subtypen zu treffen. Schlussendlich soll das Projekt dazu beitragen, die hohe Sterblichkeit bedingt durch Listerioseausbrüche zu verhindern.
Aufgrund seiner Auslegung ist das Projekt an der Schnittstelle zwischen der Mikrobiologie und der Informatik angesiedelt. Im Laufe des Meetings gaben die Mikrobiologen der Arbeitsgruppe Listeria des Robert Koch-Instituts Dr. rer. nat. Jacqueline Schürmann und Prof. Dr. rer. nat. Sven Halbedel Einblicke in Klassifizierungen von Listerien, die Struktur von Genomdaten und mögliche biologische und bioinformatische Herangehensweisen an die Fragestellung. Anschließend erläuterten die Informatiker des Fachbereichs Automatisierung und Informatik der Hochschule Harz Jing Liu und Prof. Dr.-Ing. Patrick Rempel mögliche Machine-Learning und Deep-Learning Methoden zur Bearbeitung des Projekts. Es folgte eine angeregte Diskussion über die zunächst zu verfolgenden informatischen und bioinformatischen Vorgehensweisen. Zum Abschluss des Meetings fand ein gemeinsames Mittagessen statt, welches den weiteren Austausch über das Projekt förderte und der Vernetzung der Mitarbeitenden diente.